RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 GCATO75600 419 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CDO1Q16878 200 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF534Q76KX8 674 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 GSDMBQ8TAX9 411 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 E2F7Q96AV8 911 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 A8MXQ7 604 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 IRF6O14896 467 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEC1O60732 1142 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CNMDO75829 334 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A27O95847 323 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 APRTP07741 180 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CDC25CP30307 473 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CRHR1P34998 444 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINB9P50453 376 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 RBP5P82980 135 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CYS1Q717R9 158 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 WWP1Q9H0M0 922 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NMRK1Q9NWW6 199 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 PSMG1O95456 288 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CSH1P0DML2 217 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CSH2P0DML3 217 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SDC4P31431 198 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 RCN1Q15293 331 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM110Q86TL2 294 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SPDL1Q96EA4 605 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TMPRSS15P98073 1019 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SLC6A3Q01959 620 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TBCCQ15814 346 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 FAXCQ5TGI0 409 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.36■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.36■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 GRAP2O75791 330 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 DESP17661 470 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CNTFP26441 200 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SLC34A1Q06495 639 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CA9Q16790 459 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CES4AQ5XG92 561 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ARCQ7LC44 396 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 FAM136AQ96C01 138 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 MECRQ9BV79 373 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 HMX2A2RU54 273 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 F8W8V4 182 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 KRT36O76013 467 aa23.35■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC6Q16204 474 aa23.35■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 MUM1Q2TAK8 710 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 DPH6Q7L8W6 267 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 DPP3Q9NY33 737 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3R2O00459 728 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 UGT1A9O60656 530 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 BPGMP07738 259 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN9P43378 593 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NR2C2P49116 596 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 HDAC4P56524 1084 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 CHI3L2Q15782 390 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.34■■□□□ 1.33
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