RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PREBQ9HCU5 417 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 THAP1Q9NVV9 213 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 YDJCA8MPS7 323 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHADO15335 359 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGS20O76081 388 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSRP00390 522 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAG1P15918 1043 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRKCHP24723 683 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDH6P55285 790 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRM2Q14416 872 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 LGSNQ5TDP6 509 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 NME8Q8N427 588 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIC2Q96JB3 615 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPP4Q96JB8 637 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.293e-8■□□□□ 10.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PACSIN3Q9UKS6 424 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNTNAP1P78357 1384 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIN3BO75182 1162 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERBB2P04626 1255 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNA2P16389 499 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSBPP22059 807 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 GHRHRQ02643 423 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCNAQ96QF7 691 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDH22Q9UJ99 828 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIPK3Q9Y572 518 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIK3R2O00459 728 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 APOEP02649 317 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSAPP07602 524 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR3C2P08235 984 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRHR1P34998 444 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 COPAP53621 1224 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRAMD1BQ3KR37 738 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAVSQ7Z434 540 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 WNK4Q96J92 1243 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT38O76015 456 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBL1P28749 1068 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 UGT2A3Q6UWM9 527 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 XYLT1Q86Y38 959 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNPOQ9NVS9 261 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF24Q9UPV7 400 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 POMPQ9Y244 141 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARID2Q68CP9 1835 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAPN8A6NHC0 703 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 H0YCG3 227 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTR2P61160 394 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOLH1Q04609 750 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PGM2L1Q6PCE3 622 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RDM1Q8NG50 284 aa23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 GMPRP36959 345 aa23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCHPQ9BT92 498 aa23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSAD1Q9HA92 442 aa23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHN2P52757 468 aa23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDH8P55286 799 aa23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIA1P42261 906 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK18Q07002 472 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDO1Q16878 200 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 MBLAC2Q68D91 279 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD1EP15812 388 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARRB2P32121 409 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASPAP45381 313 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC1A6P48664 564 aa23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP46P62068 366 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms