RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226359.2

AFP-201, Transcript of alpha fetoprotein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AFP, Length 1,914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFP-201ENST00000226359 TNNI1P19237 187 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 AP3M2P53677 418 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 TWF1Q12792 350 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 BIRC3Q13489 604 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 STIM1Q13586 685 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 NCAPHQ15003 741 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ZBTB6Q15916 424 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PDZD3Q86UT5 571 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 WDR49Q8IV35 697 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 YAF2Q8IY57 180 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CGRRF1Q99675 332 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 STRA6Q9BX79 667 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 LGR4Q9BXB1 951 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ADAM19Q9H013 955 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CDH22Q9UJ99 828 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 YIPF1Q9Y548 306 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 COL6A3P12111 3177 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 KPNA7A9QM74 516 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PLD2O14939 933 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ADAM12O43184 909 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ABLIM3O94929 683 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PAPLNO95428 1278 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CYP11A1P05108 521 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SRFP11831 508 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MYL4P12829 197 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 LAMP2P13473 410 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 KRT13P13646 458 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CDC25CP30307 473 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ADSSP30520 456 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 LHX1P48742 406 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CASP5P51878 434 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 NEK2P51955 445 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 GPR17Q13304 367 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CUL4BQ13620 913 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CHPFQ8IZ52 775 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 FLCNQ8NFG4 579 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 TTC8Q8TAM2 541 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 E2F7Q96AV8 911 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PAGE5Q96GU1 130 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MYADMQ96S97 322 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 TSG101Q99816 390 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 GPR88Q9GZN0 384 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SNX25Q9H3E2 840 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 KCNK12Q9HB15 430 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 A0A1W2PQU0 124 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 MTMR11A4FU01 709 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PIRO00625 290 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PPEF2O14830 753 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CLIC2O15247 247 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 TBC1D4O60343 1298 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CAVIN2O95810 425 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ANXA13P27216 316 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CYP24A1Q07973 514 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 ITKQ08881 620 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 INPP5AQ14642 412 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 PSMD6Q15008 389 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 C4orf46Q504U0 113 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
AFP-201ENST00000226359 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms