RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ckap2Q3V1H1 664 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sema3gQ4LFA9 780 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kat7Q5SVQ0 613 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aldh1a2Q62148 518 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GartQ64737 1010 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nlrp14Q6B966 993 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hmgb4Q6P8W9 181 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mapre3Q6PER3 281 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adgrd1Q80T32 903 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mapk15Q80Y86 549 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AW551984Q8BGF0 804 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zscan22Q8BGS5 496 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfml1Q8BSH2 233 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 R3hcc1Q8BSI6 488 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Jakmip1Q8BVL9 626 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgef19Q8BWA8 802 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EtnpplQ8BWU8 499 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo48Q8CAT8 161 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8CCC3 530 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnj14Q8JZN3 434 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clec4a3Q8JZX6 237 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Upb1Q8VC97 393 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chrdl2Q8VEA6 426 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr390Q8VEZ7 311 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1353Q8VGU8 309 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bicd2Q921C5 820 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tlr3Q99MB1 905 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc12a9Q99MR3 914 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AasdhpptQ9CQF6 309 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hddc3Q9D114 179 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrrc71Q9D3W5 558 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q9D9S1 216 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cog8Q9JJA2 640 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr54Q9R0D8 334 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ca14Q9WVT6 337 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hmg20bQ9Z104 317 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arid2E9Q7E2 1828 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eml5Q8BQM8 1977 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo16Q5DU14 1919 aa5.8□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MgamB5THE2 1827 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mroh4G3X8W1 983 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tex45G3XA23 500 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cfap73J3QPZ5 306 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr743L7N1Y2 311 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KlO35082 1014 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itgb3O54890 787 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pfdn2O70591 154 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dync1i1O88485 628 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DdcO88533 480 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 C4bpaP08607 469 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gata3P23772 443 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gdf7P43029 461 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scarf2P59222 833 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adcy5P84309 1262 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ano9P86044 747 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rac2Q05144 192 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tfdp1Q08639 410 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Taar7eQ5QD09 358 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cxcl17Q5UW37 119 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zp3rQ60736 579 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sim1Q61045 765 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp1r13bQ62415 1087 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zic2Q62520 530 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Runx3Q64131 409 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Oxsr1Q6P9R2 527 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Taf1cQ6PDZ2 836 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dclk2Q6PGN3 756 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smg5Q6ZPY2 1017 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nap1l3Q794H2 544 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sgsm2Q80U12 1005 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncaph2Q8BSP2 607 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrp12Q8BUJ9 858 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cacnb2Q8CC27 655 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc8a2Q8K596 921 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plppr2Q8VCY8 343 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr393Q8VGR6 312 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a3Q920C4 213 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnajc19Q9CQV7 116 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q9D2Q3 444 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slamf8Q9D3G2 278 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NapaQ9DB05 295 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd274Q9EP73 290 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phtf1Q9QZ09 761 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Extl3Q9WVL6 918 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Elf4Q9Z2U4 655 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atg2aQ6P4T0 1914 aa5.79□□□□□ -1.48
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col7a1Q63870 2944 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.5 ms