RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	BICD1	Q96G01	975 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	HCRT	O43612	131 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MT-CO3	P00414	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRT2	P35908	639 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	RIPPLY3	P57055	190 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	C21orf59	P57076	290 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAPK7	Q13164	816 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	STK3	Q13188	491 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SV2C	Q496J9	727 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD302	Q8IX05	232 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	LSMEM2	Q8N112	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SAP25	Q8TEE9	199 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	OGT	O15294	1046 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CACNG3	O60359	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DTNB	O60941	627 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	FSBP	O95073	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TYR	P14679	529 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CKMT2	P17540	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD27	P26842	260 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACSL1	P33121	698 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAGEA11	P43364	429 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	PPP3CC	P48454	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SHB	Q15464	509 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00303	Q3SY05	128 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	BIRC7	Q96CA5	298 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA17	Q96L03	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	BBS2	Q9BXC9	721 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	THSD1	Q9NS62	852 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DERA	Q9Y315	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	BLACE	A4D250	179 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP12	O75317	370 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITGB6	P18564	788 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MUT	P22033	750 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANXA13	P27216	316 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MCM7	P33993	719 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	LSS	P48449	732 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DGKG	P49619	791 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	LIG4	P49917	911 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	COPA	P53621	1224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TAF10	Q12962	218 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	EHD2	Q9NZN4	543 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYH10	P35580	1976 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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