RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC27Q9C0I9 530 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A17Q9H1V8 727 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT82Q9NSB4 513 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD13Q9Y3M8 1113 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR5O60602 858 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1G2O75843 785 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FTH1P19P0C7X4 201 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCP20941 246 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD13P35453 343 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC14A1Q13336 389 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX30Q5VWJ9 437 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NAXDQ8IW45 347 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NELFCDQ8IXH7 590 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PNPLA1Q8N8W4 532 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 XXYLT1Q8NBI6 393 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TNIP3Q96KP6 325 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TYRP14679 529 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ATICP31939 592 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH8P55286 799 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 BIRC3Q13489 604 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR45BQ5MNZ6 344 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXJ1Q92949 421 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TNMDQ9H2S6 317 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CD93Q9NPY3 652 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MEI4A8MW99 385 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 STAU1O95793 577 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MAOBP27338 520 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8FQ08AF8 430 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF699Q32M78 642 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 BHMTQ93088 406 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD8Q9NX08 183 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR35Q9P2L0 1181 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PCNX2A6NKB5 2137 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOFQ9NZM1 2061 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRT4C9JH25 899 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNG3O60359 315 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIK2Q13002 908 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF516Q92618 1163 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRG3Q99928 467 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 XYLT2Q9H1B5 865 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FASNP49327 2511 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4KAP42356 2102 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TGFB1I1O43294 461 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKGP49619 791 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF667Q5HYK9 610 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR3DQ70Z44 454 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF507Q8TCN5 953 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRX1Q96LB2 322 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 USP28Q96RU2 1077 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM9Q9C026 710 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.221e-21■■■■■ 79.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IL37Q9NZH6 218 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH15Q96QU1 1955 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX18O95935 607 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD3Q14849 445 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT1Q86TX2 421 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO44Q9H4M3 255 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CD248Q9HCU0 757 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GPSM3Q9Y4H4 160 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GJB3O75712 270 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC130P13994 396 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CD6P30203 668 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PGFP49763 221 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K7CLP57077 242 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 AMPD3Q01432 767 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ORC1Q13415 861 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A14Q15043 492 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FUKQ8N0W3 1084 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 JAKMIP2Q96AA8 810 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMO3Q96BJ8 720 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX58Q96C10 678 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SMOQ99835 787 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DSPP15924 2871 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM92AA1XBS5 289 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 WASH3PC4AMC7 463 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC3O60645 756 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
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