RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 EPHX2P34913 555 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 AP3M2P53677 418 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CAV1Q03135 178 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 TTC30AQ86WT1 665 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 TMEM237Q96Q45 408 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CXCL11O14625 94 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 KCNN4O15554 427 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 MED7O43513 233 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PFKMP08237 780 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ELK3P41970 407 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 KRT81Q14533 505 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 STAT4Q14765 748 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 RBL1P28749 1068 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 GRIA1P42261 906 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 GRIK4Q16099 956 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ECT2Q9H8V3 914 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.67■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 UGT1A9O60656 530 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CRADDP78560 199 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 WDR90Q96KV7 1748 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 BTBD19C9JJ37 291 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PRPSAP2O60256 369 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ITGAVP06756 1048 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 KRT7P08729 469 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 LMNB2Q03252 620 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 HIC1Q14526 733 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CCDC14Q49A88 953 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 BBOF1Q8ND07 529 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 P3H4Q92791 437 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SMC6Q96SB8 1091 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PAFAH2Q99487 392 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 E2F8A0AVK6 867 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 MCF2LO15068 1137 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 APRTP07741 180 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ERFP50548 548 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 DPYSL3Q14195 570 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SURF1Q15526 300 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 BBS12Q6ZW61 710 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 EURLQ9NYK6 297 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 KBTBD13C9JR72 458 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ALOX15BO15296 676 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 GPD1P21695 349 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 CCND1P24385 295 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 IRX4P78413 519 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 BEX3Q00994 111 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 PPIL2Q13356 520 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 RIPK1Q13546 671 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 MORF4L2Q15014 288 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.65■□□□□ 0.1
CTIF-205ENST00000587860 UNC5BQ8IZJ1 945 aa15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms