RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MFSD5	Q6N075	450 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CYP4X1	Q8N118	509 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	DPYSL4	O14531	572 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SCNN1G	P51170	649 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CLCNKB	P51801	687 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	BBS12	Q6ZW61	710 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF180	Q86T96	592 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ALLC	Q8N6M5	410 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NOD1	Q9Y239	953 aa		16.36	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GABRD	O14764	452 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PRPSAP2	O60256	369 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TOMM70	O94826	608 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	LCP1	P13796	627 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HOXD10	P28358	340 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SDC4	P31431	198 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PLCB3	Q01970	1234 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CAV1	Q03135	178 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PTK7	Q13308	1070 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	LPIN1	Q14693	890 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC142	Q17RM4	750 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CROCCP2	Q86T23	111 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	AGAP11	Q8TF27	550 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SENP8	Q96LD8	212 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CALN1	Q9BXU9	219 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM163B	P0C2L3	166 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	BRAF	P15056	766 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACLY	P53396	1101 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTL9	Q8TC94	416 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CYLD	Q9NQC7	956 aa		16.35	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF623	O75123	536 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ITGAV	P06756	1048 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TTC13	Q8NBP0	860 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF169	Q8NCN4	708 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	BBOF1	Q8ND07	529 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HSFY1	Q96LI6	401 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CABYR	O75952	493 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SUN1	O94901	812 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ENDOD1	O94919	500 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT16	P08779	473 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACADSB	P45954	432 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB27A	P51159	221 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CDH6	P55285	790 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	DSC3	Q14574	896 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RFX6	Q8HWS3	928 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FITM2	Q8N6M3	262 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RAET1E	Q8TD07	263 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	KLHL29	Q96CT2	875 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RSAD1	Q9HA92	442 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		16.34	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0U1RQF3	1178 aa		16.33	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		16.33	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN5	O00501	218 aa		16.33	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ANP32D	O95626	131 aa		16.33	■□□□□ 0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ETS1	P14921	441 aa		16.33	■□□□□ 0.21

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