RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 HASPINQ8TF76 798 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TOX2Q96NM4 488 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 B3GAT3O94766 335 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ENDOD1O94919 500 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SDC4P31431 198 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP13P45452 471 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAT1P54687 386 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH6P55285 790 aa21.13■□□□□ 0.97
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PACSIN3-211ENST00000539589 LONRF1Q17RB8 773 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 BOLA3Q53S33 107 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TAOK1Q7L7X3 1001 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PCGF5Q86SE9 256 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 E7EVH7 732 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEA3O75764 348 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ADORA2BP29275 332 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA4P43358 317 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 GJA8P48165 433 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 DSC1Q08554 894 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP14Q86W24 1093 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT8Q92599 483 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC77Q9BR77 488 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL10P02778 98 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5DP30049 168 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 GATMP50440 423 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP11AP98196 1134 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TFDP2Q14188 446 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPTQ96BT3 561 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 VWCEQ96DN2 955 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CYLDQ9NQC7 956 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 GMNCA6NCL1 334 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MCF2LO15068 1137 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC24CP53992 1094 aa21.11■□□□□ 0.97
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PACSIN3-211ENST00000539589 PDK2Q15119 407 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TNIP3Q96KP6 325 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 UROC1Q96N76 676 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX21Q9UL17 535 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC3O43617 180 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM107AO95990 144 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ABHD2P08910 425 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT81Q14533 505 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 STAT4Q14765 748 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 FUKQ8N0W3 1084 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MDM1Q8TC05 714 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TEKT4Q8WW24 435 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf72Q96LT7 481 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC25Q96NG3 672 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TBCBQ99426 244 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 M0QZQ0 153 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN5O00501 218 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN15O75808 1086 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 ACADSBP45954 432 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MMRN1Q13201 1228 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 DPYSL3Q14195 570 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-211ENST00000539589 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.1■□□□□ 0.97
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