RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJB1P25685 340 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SDC4P31431 198 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CA8P35219 290 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPN9P43378 593 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 HDAC4P56524 1084 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ERVFC1P60507 584 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SMARCB1Q12824 385 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF6Q58WW2 860 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC38Q5VT99 294 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SCML4Q8N228 414 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 NT5C3BQ969T7 300 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 TBCBQ99426 244 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ZWILCHQ9H900 591 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF14Q9UBS8 474 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RFXAPO00287 272 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 DAB1O75553 588 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CXCL14O95715 111 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 GLI1P08151 1106 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 MTMR3Q13615 1198 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SCD5Q86SK9 330 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 NUP93Q8N1F7 819 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RAPGEF5Q92565 580 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM161BQ96MY7 647 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 IL37Q9NZH6 218 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM66O15016 1216 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF8O76064 485 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 FGGP02679 453 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 LTFP02788 710 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAGE8P0CG41 777 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PCK1P35558 622 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf54Q08AI8 447 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CAMK1Q14012 370 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC181Q5TID7 509 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 IRGQQ8WZA9 623 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 EDEM1Q92611 657 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 USP18Q9UMW8 372 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ATF6P18850 670 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 NOS2P35228 1153 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PAFAH1B1P43034 410 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 BNIPLQ7Z465 357 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 GIPC2Q8TF65 315 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 NPY6RQ99463 290 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 NMUR1Q9HB89 426 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 FSCN2O14926 492 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 TEX28O15482 410 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.265e-7■■□□□ 14.5
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB33AQ14088 237 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 OSER1Q9NX31 292 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 CSPG5O95196 566 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 RARAP10276 462 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 DEFB123Q8N688 67 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 SPATA17Q96L03 361 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 EPC1Q9H2F5 836 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 FNIP2Q9P278 1114 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-209ENST00000532457 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.91■■□□□ 1.26
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