RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 NAB1Q13506 487 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 NCOA4Q13772 614 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TFDP2Q14188 446 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ADGRE1Q14246 886 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 NFIXQ14938 502 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 PSMD6Q15008 389 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TLR1Q15399 786 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TAZQ16635 292 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 INSCQ1MX18 579 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ZACNQ401N2 412 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CYS1Q717R9 158 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 PPM1NQ8N819 430 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXO27Q8NI29 283 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 GCNAQ96QF7 691 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 RSAD1Q9HA92 442 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 VPS45Q9NRW7 570 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MRGBPQ9NV56 204 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 BCS1LQ9Y276 419 aa7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MATN2O00339 956 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ADCY3O60266 1144 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 E2F6O75461 281 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 BANF1O75531 89 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 RFPL1O75677 317 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 STAM2O75886 525 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TOMM70O94826 608 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM63AO94886 807 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CRTAMO95727 393 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFB10O96000 172 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 HLA-DRAP01903 254 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 APOEP02649 317 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 KITP10721 976 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 THRAP10827 490 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 PSMC3P17980 439 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TNNI1P19237 187 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 OSBPP22059 807 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 KDELR1P24390 212 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TTKP33981 857 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC1A6P48664 564 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ESRRGP62508 458 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 GTF2IP78347 998 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ROR1Q01973 937 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CNTN2Q02246 1040 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 DPYSQ14117 519 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNJ11Q14654 390 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MYLK3Q32MK0 819 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM270Q6UE05 265 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 Q6ZNX1 250 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 RDM1Q8NG50 284 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CERKQ8TCT0 537 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 HM13Q8TCT9 377 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 STON2Q8WXE9 905 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MCEEQ96PE7 176 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 MRIQ9BWK5 157 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 KLC2Q9H0B6 622 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.79□□□□□ -1.16
HMBOX1-211ENST00000524238 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms