RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GJA10Q969M2 543 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM11Q96F44 468 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SNF8Q96H20 258 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CRELD1Q96HD1 420 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 RIT2Q99578 217 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC77Q9BR77 488 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ACAD9Q9H845 621 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ECT2Q9H8V3 914 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GOPCQ9HD26 462 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 RNF146Q9NTX7 359 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SENP1Q9P0U3 644 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 USTQ9Y2C2 406 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.57□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TLDC2A0PJX2 215 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM120BA0PK00 339 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC189A1A4V9 331 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 J3QKU1 62 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 EML1O00423 815 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 MEIS1O00470 390 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 OPLAHO14841 1288 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LRP3O75074 770 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ARIH2O95376 493 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ANP32DO95626 131 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GAS8O95995 478 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PYGMP11217 842 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CHRNB2P17787 502 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ABCB4P21439 1286 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GCKP35557 465 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 MSH2P43246 934 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GPC3P51654 580 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 VAMP7P51809 220 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LIMK1P53667 647 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CDR2Q01850 454 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KCNA1Q09470 495 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GRIK3Q13003 919 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC142Q17RM4 750 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC38Q502W7 563 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KCTD1Q719H9 257 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF677Q86XU0 584 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CEP120Q8N960 986 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FBF1Q8TES7 1133 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 AGAP11Q8TF27 550 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TCP11Q8WWU5 503 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CASP10Q92851 521 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KCNN1Q92952 543 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL29Q96CT2 875 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ACCSQ96QU6 501 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 BCO2Q9BYV7 579 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FETUBQ9UGM5 382 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KLK13Q9UKR3 277 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC42Q9Y546 428 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.56□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NFASCO94856 1347 aa7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ENPP3O14638 875 aa7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 BACH1O14867 736 aa7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 EXOC3O60645 756 aa7.55□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 UNC5CO95185 931 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms