RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511145.1

FAM13A-215, Transcript of family with sequence similarity 13 member A, human

TSL 3

Gene FAM13A, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM13A-215	ENST00000511145	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ZBTB5	O15062	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	FIBP	O43427	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ATP9A	O75110	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MPIG6B	O95866	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	AMY2A	P04746	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SCG2	P13521	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TCF3	P15923	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	AMY2B	P19961	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PBX3	P40426	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PDE1A	P54750	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	IGBP1	P78318	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RAB33A	Q14088	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	NEDD9	Q14511	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SEC23A	Q15436	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ESR2	Q92731	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PIGS	Q96S52	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PCYT2	Q99447	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CWH43	Q9H720	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KCNA2	P16389	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	STAT5B	P51692	787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	JAM2	P57087	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	UBE3A	Q05086	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	IL25	Q9H293	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MEIS2	O14770	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF213	O14771	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	STAM2	O75886	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	MME	P08473	750 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	CLCN5	P51795	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	GRM4	Q14833	912 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM13A-215	ENST00000511145	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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