RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CD101Q93033 1021 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 LRP5O75197 1615 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CYB561D2O14569 222 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 RASSF9O75901 435 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 MTA2O94776 668 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CSPG5O95196 566 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PAX7P23759 505 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 AVPR1AP37288 418 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 OAZ1P54368 228 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PCSK7Q16549 785 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 BBS12Q6ZW61 710 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PIGWQ7Z7B1 504 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 OR6P1Q8NGX9 317 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EDEM1Q92611 657 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 HDAC11Q96DB2 347 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TNIP3Q96KP6 325 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 AAASQ9NRG9 546 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DDIT4Q9NX09 232 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 RGS20O76081 388 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CASP2P42575 452 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PDK4Q16654 411 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 GPC2Q8N158 579 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM136AQ96C01 138 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GUL6 1792 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNA3P22001 575 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPN4P29074 926 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC12A1Q13621 1099 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 LAMC2Q13753 1193 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 HIC1Q14526 733 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ERO1BQ86YB8 467 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX9Q8N6V9 391 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXL18Q96ME1 805 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 LGMNQ99538 433 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TSC22D3Q99576 134 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 FSD1LQ9BXM9 530 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL2P36404 184 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TWNKQ96RR1 684 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 NFASCO94856 1347 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ITGAVP06756 1048 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PAEPP09466 180 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 MGAT1P26572 445 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP3K7CLP57077 242 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 RTP1P59025 263 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CCL15Q16663 113 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF139Q8WU17 664 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 TASP1Q9H6P5 420 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 E9PBE3 544 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KLHL41O60662 606 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EPHX2P34913 555 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KLC1Q07866 573 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ADIGQ0VDE8 80 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SCARA3Q6AZY7 606 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF148Q8N7C7 305 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 IPMKQ8NFU5 416 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms