RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF81P51508 661 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CYP1B1Q16678 543 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ST3GAL2Q16842 350 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MORN5Q5VZ52 161 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CHSY1Q86X52 802 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 VPS50Q96JG6 964 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 OBP2AQ9NY56 170 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 KDM5CP41229 1560 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TISP43B9A030 160 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 VNN1O95497 513 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 LATS1O95835 1130 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ERBB2P04626 1255 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CREB1P16220 341 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RHCEP18577 417 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 IL1R2P27930 398 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 GATMP50440 423 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RENBPP51606 427 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ITGA8P53708 1063 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TIRAPP58753 221 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RHDQ02161 417 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 STK3Q13188 491 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 GRM3Q14832 879 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FAM187BQ17R55 369 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TTC8Q8TAM2 541 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MMS19Q96T76 1030 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 COL20A1Q9P218 1284 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MID2Q9UJV3 735 aa5.61□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 AGLP35573 1532 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 WDR91A4D1P6 747 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PTGER1P34995 402 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MMP13P45452 471 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FCRL6Q6DN72 434 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 VSTM1Q6UX27 236 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CNGA4Q8IV77 575 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 GALNT16Q8N428 558 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CHST8Q9H2A9 424 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RNF7Q9UBF6 113 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PREX1Q8TCU6 1659 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 A6NNZ2 444 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 A8MVJ9 347 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 EXOC5O00471 708 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DSCR3O14972 297 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 THAP12O43422 761 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MPGP29372 298 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 SEMA5AQ13591 1074 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF626Q68DY1 528 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TMEM65Q6PI78 240 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 UNC13DQ70J99 1090 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RNF44Q7L0R7 432 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 C14orf80Q86SX3 495 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CUL5Q93034 780 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms