RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 PTPRNQ16849 979 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 KIF19Q2TAC6 998 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 HECTD3Q5T447 861 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 FAM171BQ6P995 826 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 OSTM1Q86WC4 334 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GPBP1Q86WP2 473 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TMEM25Q86YD3 366 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.54□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 UCMAQ8WVF2 138 aa6.54□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 IGSF8Q969P0 613 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MMS19Q96T76 1030 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 LGMNQ99538 433 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 REEP2Q9BRK0 252 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NUP58Q9BVL2 599 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.54□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ENC1O14682 589 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GABRDO14764 452 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NPC1O15118 1278 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TRIM24O15164 1050 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 COCHO43405 550 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 HCRTO43612 131 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SLC28A2O43868 658 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGA12O60330 932 aa6.53□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 DFNA5O60443 496 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ATP2C2O75185 946 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RFPL3O75679 317 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PDGFRBP09619 1106 aa6.53□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 FUT11Q495W5 492 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 HYIQ5T013 277 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 HES3Q5TGS1 186 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DPH6Q7L8W6 267 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 FAM124AQ86V42 546 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CACUL1Q86Y37 369 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.53□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 BHMTQ93088 406 aa6.53□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 PCED1BQ96HM7 432 aa6.53□□□□□ -1.36
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CBX1-205ENST00000495350 GMIPQ9P107 970 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MGAQ8IWI9 3026 aa6.53□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PTPRJQ12913 1337 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PTPN13Q12923 2485 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 B8ZZF3 427 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TISP43B9A030 160 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 WASH3PC4AMC7 463 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PRRT4C9JH25 899 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.52□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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