RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 UBR7Q8N806 425 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 K7EQS6 105 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 APODP05090 189 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIA2P42262 883 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 LRMPQ12912 555 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 NUDT18Q6ZVK8 323 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 SCD5Q86SK9 330 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 USP33Q8TEY7 942 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 KAT7O95251 611 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 CD19P15391 556 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFRSF4P43489 277 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 STX17P56962 302 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 COG7P83436 770 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 GCNT1Q02742 428 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNH2Q12809 1159 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 PM20D1Q6GTS8 502 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 DCLK2Q8N568 766 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 LMO3Q8TAP4 145 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 EBF1Q9UH73 591 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF510Q9Y2H8 683 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 GREM1O60565 184 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 LRP3O75074 770 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 APBB3O95704 486 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 RETP07949 1114 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 SETSIPP0DME0 302 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 IRF1P10914 325 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 DMC1Q14565 340 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 STILQ15468 1287 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 CAMK4Q16566 473 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM270Q6UE05 265 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TTC30AQ86WT1 665 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 MLKLQ8NB16 471 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 GAB3Q8WWW8 586 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 DEC1Q9P2X7 70 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 O00370 1275 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBED1O96006 694 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC6A11P48066 632 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TKTL1P51854 596 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 PDE4CQ08493 712 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP68Q76N32 757 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM25Q86YD3 366 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 CNGA2Q16280 664 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ANO4Q32M45 955 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 C2orf27AQ580R0 203 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 DCLK3Q9C098 648 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 MARK1Q9P0L2 795 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ATG2BQ96BY7 2078 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 AXIN1O15169 862 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 SDHBP21912 280 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ID4P47928 161 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 C12orf40Q86WS4 652 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 SCML4Q8N228 414 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 WBP2Q969T9 261 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 LOXL4Q96JB6 756 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM81BQ96LP2 452 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D3BA6NDS4 549 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 TULP3O75386 442 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 STC2O76061 302 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 DGKEP52429 567 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 PKDCCQ504Y2 493 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP1-211ENST00000492545 Q6ZNB5 142 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms