RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 FMO5P49326 533 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 CUL2Q13617 745 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 DMC1Q14565 340 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 CCDC6Q16204 474 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 CAMK4Q16566 473 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 FBXO43Q4G163 708 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 CEP68Q76N32 757 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 SYT13Q7L8C5 426 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 KBTBD6Q86V97 674 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 TTC30AQ86WT1 665 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 UBA3Q8TBC4 463 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 PNKPQ96T60 521 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 CYLDQ9NQC7 956 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 RAB23Q9ULC3 237 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 CTNND2Q9UQB3 1225 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 USP3Q9Y6I4 520 aa13.71□□□□□ -0.21
HPS1-211ENST00000478087 BICDL2A1A5D9 508 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 AXIN1O15169 862 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KAT7O95251 611 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TIE1P35590 1138 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ANO4Q32M45 955 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 C10orf120Q5SQS8 335 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 HTR3DQ70Z44 454 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PIGZQ86VD9 579 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ALLCQ8N6M5 410 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 UBR7Q8N806 425 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 LMO3Q8TAP4 145 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TFAP2BQ92481 460 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ZSWIM1Q9BR11 485 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TBC1D14Q9P2M4 693 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 NAGPAQ9UK23 515 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 HCN2Q9UL51 889 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 USP18Q9UMW8 372 aa13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SGK1O00141 431 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TULP3O75386 442 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GABBR2O75899 941 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ADH1CP00326 375 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KLKB1P03952 638 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 HMBSP08397 361 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CNR2P34972 360 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PDE4CQ08493 712 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MIB1Q86YT6 1006 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GAB3Q8WWW8 586 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 BHMTQ93088 406 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CEP63Q96MT8 703 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MED15Q96RN5 788 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PNPLA8Q9NP80 782 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DACH1Q9UI36 760 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.69□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 A0A0A0MRY4 1105 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PIK3R2O00459 728 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GDF9O60383 454 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ADAM23O75077 832 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 STC2O76061 302 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 APODP05090 189 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RETP07949 1114 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CCDC192P0DO97 292 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CD19P15391 556 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DGKEP52429 567 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GAD2Q05329 585 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RAB41Q5JT25 222 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RRAGAQ7L523 313 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CAMKK1Q8N5S9 505 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 IL17RCQ8NAC3 791 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MLKLQ8NB16 471 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 EXOC4Q96A65 974 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms