RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1-209ENST00000469140 ATF6P18850 670 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SULT1E1P49888 294 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 HDAC4P56524 1084 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ERVK-21P61565 698 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 BNIPLQ7Z465 357 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 GPR152Q8TDT2 470 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TBCBQ99426 244 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SLC38A8A6NNN8 435 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 IL1R2P27930 398 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 GJC1P36383 396 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ALDH1A3P47895 512 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 USP46P62068 366 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 BOLA3Q53S33 107 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.62■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PRRG1O14668 218 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ITIH3Q06033 890 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ODF2Q5BJF6 829 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SCD5Q86SK9 330 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 GIPC2Q8TF65 315 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ZWILCHQ9H900 591 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 YIPF1Q9Y548 306 aa24.61■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 H0YGN5 161 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 M0QYT0 321 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 LPXNO60711 386 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 DNAJB1P25685 340 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CETN2P41208 172 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PSEN1P49768 467 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 STKLD1Q8NE28 680 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 EDEM1Q92611 657 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 FBXO32Q969P5 355 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 F9P00740 461 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 FGGP02679 453 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CSH1P0DML2 217 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CSH2P0DML3 217 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 COPS2P61201 443 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RAB30Q15771 203 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RAB6CQ53S08 254 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 LILRA6Q6PI73 481 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SPRED2Q7Z698 418 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TEKT4Q8WW24 435 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 MSRAQ9UJ68 235 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 A0A1W2PQH9 124 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 FSCN2O14926 492 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TGM5O43548 720 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 KRT1P04264 644 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 RARAP10276 462 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 KLRC2P26717 231 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TUBB4BP68371 445 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TAF10Q12962 218 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 MTMR3Q13615 1198 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 VEPH1Q14D04 833 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PEBP4Q96S96 227 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 NMUR1Q9HB89 426 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 TMEM51Q9NW97 253 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 GMIPQ9P107 970 aa24.59■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 H3BNC9 293 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 GRM6O15303 877 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 BMP8BP34820 402 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 DEUP1Q05D60 604 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 PLD1Q13393 1074 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.58■■□□□ 1.53
MTA1-209ENST00000469140 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms