RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 TLR5O60602 858 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 GLULP15104 373 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 AOC1P19801 751 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 PDGFRLQ15198 375 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 RAB41Q5JT25 222 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 TAF3Q5VWG9 929 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 TTC16Q8NEE8 873 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 CEP83Q9Y592 693 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 CPQQ9Y646 472 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.83■■□□□ 1.09
C4orf48-201ENST00000409248 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 MAN2B1O00754 1011 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 COCHO43405 550 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 PRKCIP41743 596 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 TKTL1P51854 596 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 CDR2Q01850 454 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 PKDCCQ504Y2 493 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 UBA3Q8TBC4 463 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJC7Q99615 494 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 RNF38Q9H0F5 515 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 CYLDQ9NQC7 956 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 NAGPAQ9UK23 515 aa21.82■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 LEFTY2O00292 366 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 RALAP11233 206 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 AVPR2P30518 371 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 IFNAR2P48551 515 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ADIGQ0VDE8 80 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 IER5LQ5T953 404 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SPC24Q8NBT2 197 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 RIN3Q8TB24 985 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 GKN1Q9NS71 199 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 A0A1W2PQH9 124 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 TULP2O00295 520 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ZBED1O96006 694 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SERPING1P05155 500 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 MMEP08473 750 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 NUBP1P53384 320 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ARID5BQ14865 1188 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 PJA1Q8NG27 643 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ATP2A3Q93084 1043 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 NELL2Q99435 816 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 PRRX2Q99811 253 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 AGPAT1Q99943 283 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 LHX5Q9H2C1 402 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.8■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 COL4A3Q01955 1670 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 RARGP13631 454 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 COL9A1P20849 921 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 TNK2Q07912 1038 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 PASD1Q8IV76 773 aa21.79■■□□□ 1.08
C4orf48-201ENST00000409248 CPA6Q8N4T0 437 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms