RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 GIPC2Q8TF65 315 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 M0QYT0 321 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 FYNP06241 537 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 HDAC4P56524 1084 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 STRADAQ7RTN6 431 aa21.4■■□□□ 1.02
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ATG4B-204ENST00000402096 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA17Q96L03 361 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 PEBP4Q96S96 227 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 SEC24AO95486 1093 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 CXCL14O95715 111 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ATF2P15336 505 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 YWHAQP27348 245 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 34.1
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ATG4B-204ENST00000402096 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 NME3Q13232 169 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RAB33AQ14088 237 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 KCTD6Q8NC69 237 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 NPY6RQ99463 290 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 FNIP2Q9P278 1114 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SCML2Q9UQR0 700 aa21.39■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 TEX28O15482 410 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RARAP10276 462 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ATF6P18850 670 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ELF1P32519 619 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 DEUP1Q05D60 604 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ITIH3Q06033 890 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 MTMR3Q13615 1198 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 GPR65Q8IYL9 337 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ADAM32Q8TC27 787 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RAPGEF5Q92565 580 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO32Q969P5 355 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 TCF25Q9BQ70 676 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PQH9 124 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 PRRG1O14668 218 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RALAP11233 206 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RRN3Q9NYV6 651 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 LILRB3O75022 631 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 CA3P07451 260 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 BOLA3Q53S33 107 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 KAZNQ674X7 775 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SPRED2Q7Z698 418 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 SCD5Q86SK9 330 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 FAM131BQ86XD5 332 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 TNS4Q8IZW8 715 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.37■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 NT5C3BQ969T7 300 aa21.37■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.37■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 LZTS1Q9Y250 596 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 KDELR1P24390 212 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 ALDH1A3P47895 512 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 TUBB4BP68371 445 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 KRT81Q14533 505 aa21.36■■□□□ 1.01
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ATG4B-204ENST00000402096 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-204ENST00000402096 MON1AQ86VX9 555 aa21.36■■□□□ 1.01
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