RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 DACH1Q9UI36 760 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SDK1Q7Z5N4 2213 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 RETP07949 1114 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 STX17P56962 302 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CUL2Q13617 745 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 C2orf27AQ580R0 203 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 SCD5Q86SK9 330 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ACDQ96AP0 544 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PNKPQ96T60 521 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 USP3Q9Y6I4 520 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 MDM4O15151 490 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GREM1O60565 184 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 RARGP13631 454 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GAD2Q05329 585 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 SPEM2Q0P670 501 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 LRMPQ12912 555 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GAB3Q8WWW8 586 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 USP18Q9UMW8 372 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 DMXL1Q9Y485 3027 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 HTR3DQ70Z44 454 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM25Q86YD3 366 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 NT5C1BQ96P26 610 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 NAGPAQ9UK23 515 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 AXIN1O15169 862 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 KAT7O95251 611 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 APODP05090 189 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 KDSRQ06136 332 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 KCNH2Q12809 1159 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PIGZQ86VD9 579 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 TTC30AQ86WT1 665 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 UBR7Q8N806 425 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 NAT16Q8N8M0 369 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 A0A0A0MRY4 1105 aa24.72■■□□□ 1.55
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FAAP20-201ENST00000378543 APBB3O95704 486 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PSEN1P49768 467 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 SLC8A3P57103 927 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 TULP2O00295 520 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GRIA2P42262 883 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 PLA2G4AP47712 749 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ANO4Q32M45 955 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 RAB41Q5JT25 222 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 EMC10Q5UCC4 262 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 KBTBD6Q86V97 674 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF276Q8N554 614 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 FAM81BQ96LP2 452 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-201ENST00000378543 LRP3O75074 770 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 TULP3O75386 442 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 CD19P15391 556 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 TIE1P35590 1138 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 GCNT1Q02742 428 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 PDE4CQ08493 712 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 SGO2Q562F6 1265 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-201ENST00000378543 LMO3Q8TAP4 145 aa24.7■■□□□ 1.54
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