RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT71Q3SY84 523 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TUBB8Q3ZCM7 444 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF6Q58WW2 860 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA0319Q5VV43 1072 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM171BQ6P995 826 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMOQ99835 787 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMBIM4Q9HC24 238 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PNPLA8Q9NP80 782 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 H3BRJ5 948 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 H7C0C1 242 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 BEST1O76090 585 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZBED1O96006 694 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFNB1P01574 187 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBP3P10745 1247 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 STIP1P31948 543 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ACTN2P35609 894 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR1G1P47890 313 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP5OP48047 213 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDR1P51861 262 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEUP1Q05D60 604 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF844Q08AG5 666 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAB41Q5JT25 222 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCML4Q8N228 414 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 HASPINQ8TF76 798 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZBTB9Q96C00 473 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAF2Q96CS3 445 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CENPHQ9H3R5 247 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TBC1D13Q9NVG8 400 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.56□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYO16Q9Y6X6 1858 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 H0YGN5 161 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 M0QYT0 321 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYN3O14994 580 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RIPK2O43353 540 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 LTFP02788 710 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCL5P13501 91 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYP2F1P24903 491 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 NR2C2P49116 596 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 MMRN1Q13201 1228 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC142Q17RM4 750 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTMPQ5BVD1 217 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 EFHC2Q5JST6 749 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC9A4Q6AI14 798 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 C4orf22Q6V702 233 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARL8AQ96BM9 186 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTC25Q96NG3 672 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB118Q96PH6 123 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC9A7Q96T83 725 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPY6RQ99463 290 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 FERMT1Q9BQL6 677 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 COLEC11Q9BWP8 271 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM51Q9NW97 253 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 NFS1Q9Y697 457 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCNTO95613 3336 aa13.55□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCDC2CA8MYV0 355 aa13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ENPP3O14638 875 aa13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 TADA2AO75478 443 aa13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDHD2O94830 711 aa13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 F9P00740 461 aa13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 IVLP07476 585 aa13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 L1CAMP32004 1257 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms