RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366960.7

RPS6KC1-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 GPAMQ9HCL2 828 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PXMP2Q9NR77 195 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CFAP99D6REC4 459 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 KCNK1O00180 336 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 HOXD10P28358 340 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 BAIAP3O94812 1187 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NFYCQ13952 458 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CATSPER2Q96P56 530 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 APPL1Q9UKG1 709 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SOX13Q9UN79 622 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 BACE1P56817 501 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CRYMQ14894 314 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 DNAJC18Q9H819 358 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 MRGBPQ9NV56 204 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 INTS13Q9NVM9 706 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 THPOP40225 353 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 STKLD1Q8NE28 680 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NAT9Q9BTE0 207 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 RGS5O15539 181 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PDE5AO76074 875 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADRA1DP25100 572 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CASP5P51878 434 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 BCAT1P54687 386 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CCNJLQ8IV13 435 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 USE1Q9NZ43 259 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PIAS1O75925 651 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CDH18Q13634 790 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CCDC142Q17RM4 750 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 GPR141Q7Z602 305 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 OSMRQ99650 979 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 RCCD1A6NED2 376 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 VWA5AO00534 786 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CLPTM1O96005 669 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 MYBL2P10244 700 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATP6V1B2P21281 511 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 MEA1Q16626 185 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTMPQ5BVD1 217 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 WDR49Q8IV35 697 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 STX19Q8N4C7 294 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADAM32Q8TC27 787 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NT5MQ9NPB1 228 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 RNF19AQ9NV58 838 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PRIM2P49643 509 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CHRNB3Q05901 458 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 EFEMP1Q12805 493 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 MMRN1Q13201 1228 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 BNIPLQ7Z465 357 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SERPINB1P30740 379 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NDST1P52848 882 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 MGAT5Q09328 741 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 FAAP100Q0VG06 881 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 CAPN10Q9HC96 672 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-202ENST00000366960 WDR27A2RRH5 827 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms