RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 RRM2BQ7LG56 351 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00471Q8N535 108 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP10Q96AY3 582 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CEP170P1Q96L14 293 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A23Q9BV35 468 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM9Q9C026 710 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ING3Q9NXR8 418 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CYP39A1Q9NYL5 469 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC53A6NM62 1247 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CHADO15335 359 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TCEA3O75764 348 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EPN2O95208 641 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 DLG1Q12959 904 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 SEL1L3Q68CR1 1132 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SKA1Q96BD8 255 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ULK4Q96C45 1275 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 IFT43Q96FT9 208 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 SPACA6W5XKT8 324 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TYSND1Q2T9J0 566 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TBCKQ8TEA7 893 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DPF2Q92785 391 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PIGSQ96S52 555 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RMDN3Q96TC7 470 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JLW4 131 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 BAIAP3O94812 1187 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 AKAP5P24588 427 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FMO5P49326 533 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CRY1Q16526 586 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 DPH6Q7L8W6 267 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 QRFPRQ96P65 431 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 C18orf8Q96DM3 657 aa5.06□□□□□ -1.6
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