RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC8A3P57103 927 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP4F8P98187 520 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 RAB41Q5JT25 222 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 HDXQ7Z353 690 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 LEMD2Q8NC56 503 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TLR10Q9BXR5 811 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 IL37Q9NZH6 218 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM50BQ9Y247 325 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM92AA1XBS5 289 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 GABBR2O75899 941 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 F11P03951 625 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 MMEP08473 750 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FERP16591 822 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CHRNB2P17787 502 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 YWHAQP27348 245 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDC25CP30307 473 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 RGS7P49802 495 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FMO1Q01740 532 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDR2Q01850 454 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TEAD2Q15562 447 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PMF1Q6P1K2 205 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF677Q86XU0 584 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 COG1Q8WTW3 980 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FBXO32Q969P5 355 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ASB2Q96Q27 587 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 MYADMQ96S97 322 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 EHD2Q9NZN4 543 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 COL6A3P12111 3177 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM170AA1A519 330 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 H3BQF6 201 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PIK3R2O00459 728 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF197O14709 1029 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FGF19O95750 216 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TKTL1P51854 596 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADIGQ0VDE8 80 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAF10Q12962 218 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PDCLQ13371 301 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CASP8Q14790 479 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 POTEHQ6S545 545 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FGF13Q92913 245 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 GCNAQ96QF7 691 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYT11Q9BT88 431 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZMYND15Q9H091 742 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 LHX5Q9H2C1 402 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 COMMD8Q9NX08 183 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 GMIPQ9P107 970 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 USP3Q9Y6I4 520 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 NCANO14594 1321 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 E5RJQ4 531 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC172P0C7W6 258 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 BMP1P13497 986 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 LCP1P13796 627 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PGFP49763 221 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOMO3P69849 1222 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 C2orf54Q08AI8 447 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 GPR158Q5T848 1215 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms