RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PAK5Q9P286 719 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CPP00450 1065 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CYP2F1P24903 491 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 RBL1P28749 1068 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CTGFP29279 349 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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RTKN-201ENST00000233330 BBS9Q3SYG4 887 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FUKQ8N0W3 1084 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.5■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CHADO15335 359 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ATP2C2O75185 946 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CAPN15O75808 1086 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FSBPO95073 299 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 STX2P32856 288 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ITIH4Q14624 930 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 RGMBQ6NW40 437 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PIGZQ86VD9 579 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 TRABDQ9H4I3 376 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SENP1Q9P0U3 644 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CYB561D2O14569 222 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MAP3K6O95382 1288 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ZBED1O96006 694 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 TSHRP16473 764 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 KRT15P19012 456 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.871e-7■■■■□ 20.6
RTKN-201ENST00000233330 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 STRADAQ7RTN6 431 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SGSM3Q96HU1 749 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 DUSP16Q9BY84 665 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.49■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 M0QZ92 97 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 18.7
RTKN-201ENST00000233330 KPNA6O60684 536 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GNASQ5JWF2 1037 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PALM2Q8IXS6 379 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CCDC185Q8N715 623 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FBF1Q8TES7 1133 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.48■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GABRDO14764 452 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MATKP42679 507 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GJA9P57773 515 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ADIGQ0VDE8 80 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CRHR2Q13324 411 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 WSCD1Q658N2 575 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CCT6BQ92526 530 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 MAGEB18Q96M61 343 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CLDN5O00501 218 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SNX3O60493 162 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SPAG7O75391 227 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SLC10A3P09131 477 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 FAM163BP0C2L3 166 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 NPR3P17342 541 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SLC18A1P54219 525 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SLC8A3P57103 927 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 INHBEP58166 350 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 CBLBQ13191 982 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.47■□□□□ 0.87
RTKN-201ENST00000233330 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.47■□□□□ 0.87
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