RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8271L7N2E2 218 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CcnjlQ5SRT8 387 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf569Q80W31 679 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q8CC96 669 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 S100pbpQ9D5K4 396 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Msh5Q9QUM7 833 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ap4s1Q9WVL1 144 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stx7O70439 261 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccnd2P30280 289 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CratP47934 626 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 NfixP70257 488 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Aqp1Q02013 269 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RelaQ04207 549 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vars2Q3U2A8 1060 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CttnQ60598 546 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mxd3Q80US8 206 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem39bQ810L4 492 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prkaa2Q8BRK8 552 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rmdn2Q8BSE0 410 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slx1bQ8BX32 270 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gmcl1Q920G9 524 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lpin2Q99PI5 893 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DmgdhQ9DBT9 869 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gmeb1Q9JL60 562 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r7E9PYL5 915 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8237E9Q257 205 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r3H3BJ88 915 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r6H3BK29 913 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rgs2O08849 211 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pex5O09012 639 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 OmdO35103 423 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CidebO70303 219 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmprss15P97435 1069 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chrna5Q2MKA5 467 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc38a5Q3U1J0 479 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dph1Q5NCQ5 438 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Frmd5Q6P5H6 517 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmc3Q7TQ69 1130 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klhl31Q8BWA5 634 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pgm5Q8BZF8 567 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 NcaldQ91X97 193 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Txndc12Q9CQU0 170 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vta1Q9CR26 309 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpina1fQ9DCQ7 411 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam47eD3YWC7 402 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Wdr72D3YYM4 1114 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm7535F7CXE4 302 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mmp13P33435 472 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Aars2Q14CH7 980 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PnocQ64387 187 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ZfatQ7TS63 1237 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SntnQ8C9X1 147 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atg14Q8CDJ3 492 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Irak4Q8R4K2 459 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Guca1bQ8VBV8 201 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2c70Q91W64 489 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smim11aQ99J19 55 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Batf3Q9D275 118 aa9.6□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abcc10Q8R4P9 1501 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr292F8VQ84 308 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Speer4eK7N6S8 255 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdh16O88338 830 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CartptP56388 129 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Phactr1Q2M3X8 580 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cul4aQ3TCH7 759 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Syce2Q505B8 171 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp7Q6A4J8 1103 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 EtnpplQ8BWU8 499 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Snx30Q8CE50 437 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Oxnad1Q8VE38 311 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcdha3Q91Y16 942 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chmp1b1Q99LU0 199 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nkd1Q99MH6 471 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rassf3Q99P51 232 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rab11fip1Q9D620 645 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pgam1Q9DBJ1 254 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm11983V9GXS8 105 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kpna7C0LLJ0 499 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bmpr2O35607 1038 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ap3d1O54774 1199 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 IgfalsP70389 603 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rnf113a2Q14B01 337 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gprin1Q3UNH4 932 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gcnt3Q5JCT0 437 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Soat1Q61263 540 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Camta2Q80Y50 1208 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddhd1Q80YA3 547 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms