Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccnd2P30280 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccnd2P30280 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccnd2P30280 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccnd2P30280 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccnd2P30280 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccnd2P30280 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccnd2P30280 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccnd2P30280 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccnd2P30280 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccnd2P30280 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccnd2P30280 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccnd2P30280 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccnd2P30280 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccnd2P30280 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccnd2P30280 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccnd2P30280 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccnd2P30280 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccnd2P30280 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccnd2P30280 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccnd2P30280 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccnd2P30280 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccnd2P30280 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccnd2P30280 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccnd2P30280 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccnd2P30280 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccnd2P30280 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccnd2P30280 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccnd2P30280 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccnd2P30280 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccnd2P30280 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccnd2P30280 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccnd2P30280 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccnd2P30280 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccnd2P30280 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccnd2P30280 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccnd2P30280 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccnd2P30280 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccnd2P30280 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccnd2P30280 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccnd2P30280 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccnd2P30280 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccnd2P30280 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccnd2P30280 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccnd2P30280 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccnd2P30280 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccnd2P30280 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccnd2P30280 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccnd2P30280 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccnd2P30280 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccnd2P30280 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccnd2P30280 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccnd2P30280 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccnd2P30280 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccnd2P30280 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccnd2P30280 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccnd2P30280 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccnd2P30280 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccnd2P30280 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccnd2P30280 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccnd2P30280 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccnd2P30280 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccnd2P30280 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccnd2P30280 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccnd2P30280 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccnd2P30280 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccnd2P30280 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccnd2P30280 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccnd2P30280 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccnd2P30280 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccnd2P30280 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccnd2P30280 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccnd2P30280 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccnd2P30280 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccnd2P30280 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccnd2P30280 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccnd2P30280 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccnd2P30280 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccnd2P30280 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccnd2P30280 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccnd2P30280 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccnd2P30280 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccnd2P30280 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccnd2P30280 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccnd2P30280 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccnd2P30280 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ccnd2P30280 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccnd2P30280 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccnd2P30280 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccnd2P30280 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccnd2P30280 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccnd2P30280 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccnd2P30280 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccnd2P30280 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccnd2P30280 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccnd2P30280 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccnd2P30280 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccnd2P30280 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccnd2P30280 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccnd2P30280 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms