Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,99■■■■■ 4,15
Ccnd2P30280 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Ccnd2P30280 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Ccnd2P30280 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Ccnd2P30280 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Ccnd2P30280 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
Ccnd2P30280 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Ccnd2P30280 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Ccnd2P30280 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Ccnd2P30280 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Ccnd2P30280 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Ccnd2P30280 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Ccnd2P30280 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,43■■■■□ 3,1
Ccnd2P30280 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Ccnd2P30280 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Ccnd2P30280 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ccnd2P30280 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Ccnd2P30280 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Ccnd2P30280 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Ccnd2P30280 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ccnd2P30280 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ccnd2P30280 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Ccnd2P30280 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ccnd2P30280 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Ccnd2P30280 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ccnd2P30280 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Ccnd2P30280 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccnd2P30280 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ccnd2P30280 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Ccnd2P30280 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Ccnd2P30280 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,2■■■□□ 2,91
Ccnd2P30280 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Ccnd2P30280 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Ccnd2P30280 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Ccnd2P30280 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Ccnd2P30280 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Ccnd2P30280 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ccnd2P30280 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ccnd2P30280 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Ccnd2P30280 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Ccnd2P30280 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Ccnd2P30280 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Ccnd2P30280 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Ccnd2P30280 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Ccnd2P30280 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Ccnd2P30280 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Ccnd2P30280 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Ccnd2P30280 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Ccnd2P30280 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Ccnd2P30280 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Ccnd2P30280 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Ccnd2P30280 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ccnd2P30280 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Ccnd2P30280 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ccnd2P30280 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,87■■■□□ 2,69
Ccnd2P30280 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
Ccnd2P30280 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Ccnd2P30280 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Ccnd2P30280 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Ccnd2P30280 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Ccnd2P30280 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Ccnd2P30280 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Ccnd2P30280 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Ccnd2P30280 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Ccnd2P30280 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Ccnd2P30280 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Ccnd2P30280 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Ccnd2P30280 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Ccnd2P30280 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Ccnd2P30280 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Ccnd2P30280 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ccnd2P30280 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Ccnd2P30280 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Ccnd2P30280 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Ccnd2P30280 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Ccnd2P30280 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Ccnd2P30280 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ccnd2P30280 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ccnd2P30280 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ccnd2P30280 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Ccnd2P30280 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ccnd2P30280 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ccnd2P30280 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Ccnd2P30280 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ccnd2P30280 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ccnd2P30280 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Ccnd2P30280 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Ccnd2P30280 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Ccnd2P30280 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Ccnd2P30280 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Ccnd2P30280 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Ccnd2P30280 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Ccnd2P30280 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ccnd2P30280 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ccnd2P30280 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Ccnd2P30280 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Ccnd2P30280 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ccnd2P30280 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ccnd2P30280 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ccnd2P30280 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,6 ms