RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akt3Q9WUA6 479 aa16.64■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8444F6XS56 118 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3r2O08908 722 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RenbpP82343 430 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cog7Q3UM29 770 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd6Q69ZU8 712 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd15Q8K0E1 283 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TfQ921I1 697 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mbd1Q9Z2E2 636 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kifc5bE9PUA5 672 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3264L7N2C5 238 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DldO08749 509 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxc10P31257 342 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CstaP56567 97 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c29Q64458 490 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl14Q69ZK5 630 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cand2Q6ZQ73 1235 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ip6k2Q80V72 448 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acvr1cQ8K348 493 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssx2ipQ8VC66 615 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb7Q9QYI8 312 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ripk3Q9QZL0 486 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PolgP54099 1218 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NrlP54846 237 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Soat1Q61263 540 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Moxd2Q7TT41 619 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map1sQ8C052 973 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr395Q8VGR3 312 aa16.63■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IqccA2ADZ8 418 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apol11aE9PZG0 334 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam71e2L7N480 754 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tac1P41539 130 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ezh1P70351 747 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irak3Q8K4B2 609 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgat5Q8R4G6 740 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chmp2aQ9DB34 222 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cntn6Q9JMB8 1028 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf19bA2A7Q9 732 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NxnP97346 435 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otud5Q3U2S4 566 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubn1Q4G0F8 1135 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thnsl1Q8BH55 747 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbx20Q9ES03 445 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hes6Q9JHE6 224 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Actl7bQ9QY83 418 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpc2Q9R244 1172 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nr3c1P06537 783 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pla2g6P97819 807 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hace1Q3U0D9 909 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3UE31 404 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gucy2gQ6TL19 1100 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Maged2Q9ER67 616 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Copg2Q9QXK3 871 aa16.62■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifnar2O35664 513 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxc6P10629 235 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ass1P16460 412 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Drg1P32233 367 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn11P35235 597 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mxi1P50540 228 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl17Q6TDP3 640 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam185aQ7TPD2 378 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata21Q8BHW6 681 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anxa9Q9JHQ0 345 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptar1E9QAB6 424 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r39L7N2E5 861 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xbp1O35426 267 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm1604bQ3TRG0 118 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LbpQ61805 481 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GnasQ6R0H7 1133 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam151aQ8QZW3 608 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp64Q99KE8 643 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LipaQ9Z0M5 397 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb12Q9Z150 459 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exoc7O35250 697 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx25Q3ZT31 840 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xlr3aQ60595 226 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddr2Q62371 854 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrf4Q9D2L6 698 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata1Q9D5R4 444 aa16.61■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cntnap4Q99P47 1310 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinb3aG3X9V8 387 aa16.6■□□□□ 0.25
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EpoP07321 192 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.4 ms