RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)Q1

tT(UGU)Q1, Transcript of Mitochondrial threonine tRNA (tRNA-Thr), yeastyeast

Gene tT(UGU)Q1, Length 76 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TY1B-DR4Q07793 1604 aa-1.92□□□□□ -2.72
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YOR093CQ12275 1648 aa-1.93□□□□□ -2.72
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 Q0017Q9ZZX8 53 aa-1.94□□□□□ -2.72
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 THO2P53552 1597 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YOR192C-CQ3E736 78 aa-1.97□□□□□ -2.72
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.73
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MYO4P32492 1471 aa-2.01□□□□□ -2.73
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YOR316C-AQ3E806 69 aa-2.09□□□□□ -2.74
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-2.12□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YDR034C-AP0C289 58 aa-2.12□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CSF1Q12150 2958 aa-2.12□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YML054C-AQ3E809 52 aa-2.13□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CUP1-1P0CX80 61 aa-2.14□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CUP1-2P0CX81 61 aa-2.14□□□□□ -2.75
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-2.16□□□□□ -2.76
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 VMA9Q3E7B6 73 aa-2.19□□□□□ -2.76
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YCF1P39109 1515 aaKnown RBP-2.2□□□□□ -2.76
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 FLO1P32768 1537 aa-2.21□□□□□ -2.76
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YBT1P32386 1661 aa-2.25□□□□□ -2.77
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-2.29□□□□□ -2.78
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TRA1P38811 3744 aa-2.33□□□□□ -2.78
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SSK2P53599 1579 aa-2.36□□□□□ -2.79
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-2.37□□□□□ -2.79
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YFR010W-AP0C5N0 62 aa-2.42□□□□□ -2.8
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 IRA1P18963 3092 aa-2.45□□□□□ -2.8
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 BUD3P25558 1636 aa-2.45□□□□□ -2.8
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ATG2P53855 1592 aa-2.49□□□□□ -2.81
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 DDR2P89113 61 aa-2.51□□□□□ -2.81
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-2.52□□□□□ -2.81
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 STU1P38198 1513 aa-2.52□□□□□ -2.81
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 COX9P07255 59 aa-2.53□□□□□ -2.81
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GCN2P15442 1659 aa-2.55□□□□□ -2.82
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NUM1Q00402 2748 aa-2.55□□□□□ -2.82
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YHR073W-AP0C5N7 58 aa-2.59□□□□□ -2.82
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CDC25P04821 1589 aa-2.59□□□□□ -2.82
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NUP170P38181 1502 aa-2.62□□□□□ -2.83
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-2.62□□□□□ -2.83
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 IRA2P19158 3079 aa-2.62□□□□□ -2.83
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NUP192P47054 1683 aa-2.66□□□□□ -2.84
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YLR342W-AQ3E810 57 aa-2.68□□□□□ -2.84
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 USO1P25386 1790 aa-2.69□□□□□ -2.84
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PEP1P32319 1579 aa-2.72□□□□□ -2.84
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 HIR3P47171 1648 aa-2.8□□□□□ -2.86
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ULS1Q08562 1619 aa-2.8□□□□□ -2.86
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 VPS13Q07878 3144 aa-2.89□□□□□ -2.87
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YJL127C-BQ3E828 52 aa-2.9□□□□□ -2.87
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RKR1Q04781 1562 aa-2.93□□□□□ -2.88
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SMX2P40204 77 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-3.13□□□□□ -2.91
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PMP3P87284 55 aa-3.14□□□□□ -2.91
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 HOR7Q05827 59 aa-3.37□□□□□ -2.95
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-3.41□□□□□ -2.96
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-3.52□□□□□ -2.97
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TOM7P53507 60 aa-3.64□□□□□ -2.99
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MLP2P40457 1679 aa-3.76□□□□□ -3.01
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NCE101Q02820 53 aa-4.12□□□□□ -3.07
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TOM1Q03280 3268 aa-4.18□□□□□ -3.08
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL39P04650 51 aa-4.78□□□□□ -3.17
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 Q0297Q9ZZV8 51 aa-5.29□□□□□ -3.26
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-5.49□□□□□ -3.29
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-7.27□□□□□ -3.57
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