RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM155BO75949 473 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 WDR47O94967 919 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 AGR2O95994 175 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 C1SP09871 688 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ITGAMP11215 1152 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CD19P15391 556 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CD53P19397 219 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 HTR7P34969 479 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ADD2P35612 726 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 LIPAP38571 399 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CSHL1Q14406 222 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CLCA4Q14CN2 919 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TBCCQ15814 346 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 BTBD16Q32M84 506 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 P3H1Q32P28 736 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 VWA1Q6PCB0 445 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 MAVSQ7Z434 540 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 LNX2Q8N448 690 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ASB10Q8WXI3 467 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 HAS1Q92839 578 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RILPL2Q969X0 211 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 R3HDM4Q96D70 268 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PGBD1Q96JS3 809 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 WDR24Q96S15 920 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 B9A039 149 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 NCAM2O15394 837 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 DHHO43323 396 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PEX11BO96011 259 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PYGLP06737 847 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 FESP07332 822 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF20P17024 532 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PTGS2P35354 604 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CLCN2P51788 898 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PRKAA2P54646 552 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CUL4BQ13620 913 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CDSNQ15517 529 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TREML2Q5T2D2 321 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RRAGAQ7L523 313 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 AFG1LQ8WV93 481 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 C3orf49Q96BT1 292 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR20Q99678 358 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 H0Y3Z8 333 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 YY2O15391 372 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PROM1O43490 865 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP6R2O75170 966 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CHRM2P08172 466 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM225BP0DP42 221 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 PBX1P40424 430 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ADAM17P78536 824 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ACOX1Q15067 660 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 RPS6KA2Q15349 733 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TICAM2Q86XR7 235 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 THAP4Q8WY91 577 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 LENG9Q96B70 501 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 FBXL20Q96IG2 436 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 Q96MF0 132 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 ALG8Q9BVK2 526 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms