RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 AIFM3Q96NN9 605 aa5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.4□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 DPP7Q9UHL4 492 aa5.4□□□□□ -1.54
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PRPF8-211ENST00000574728 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.4□□□□□ -1.54
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PRPF8-211ENST00000574728 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
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PRPF8-211ENST00000574728 TRIM13O60858 407 aa5.38□□□□□ -1.55
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PRPF8-211ENST00000574728 FSBPO95073 299 aa5.38□□□□□ -1.55
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PRPF8-211ENST00000574728 MTNR1BP49286 362 aa5.38□□□□□ -1.55
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PRPF8-211ENST00000574728 CPT1AP50416 773 aa5.38□□□□□ -1.55
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PRPF8-211ENST00000574728 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.38□□□□□ -1.55
PRPF8-211ENST00000574728 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PRPF8-211ENST00000574728 METTL7BQ6UX53 244 aa5.38□□□□□ -1.55
PRPF8-211ENST00000574728 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.38□□□□□ -1.55
PRPF8-211ENST00000574728 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.38□□□□□ -1.55
PRPF8-211ENST00000574728 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
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