RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 CPB1P15086 417 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 GRIK1P39086 918 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC5A3P53794 718 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 HDAC4P56524 1084 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 SNX16P57768 344 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 BNIPLQ7Z465 357 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 RNF14Q9UBS8 474 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-209ENST00000559551 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DAB1O75553 588 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ZBED1O96006 694 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 OR1D2P34982 312 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MAGEA11P43364 429 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPN9P43378 593 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 USP46P62068 366 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ADCY2Q08462 1091 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TEX35Q5T0J7 233 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 LRRC38Q5VT99 294 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GPR152Q8TDT2 470 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RAPGEF5Q92565 580 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NT5C3BQ969T7 300 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TBCBQ99426 244 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 INSL6Q9Y581 213 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 LILRB3O75022 631 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HSF2BPO75031 334 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FBXO21O94952 628 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SDC4P31431 198 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MATKP42679 507 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ITIH3Q06033 890 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC181Q5TID7 509 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 VSTM1Q6UX27 236 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SCML4Q8N228 414 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FIBCD1Q8N539 461 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 C8orf48Q96LL4 319 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC9A7Q96T83 725 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NPY6RQ99463 290 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RAD9AQ99638 391 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ZWILCHQ9H900 591 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FGF18O76093 207 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SEC24AO95486 1093 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MYOGP15173 224 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PCK1P35558 622 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PAFAH1B1P43034 410 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GLUD2P49448 558 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DUSP4Q13115 394 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ACAP1Q15027 740 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SCD5Q86SK9 330 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 VPS52Q8N1B4 723 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DPF3Q92784 378 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 USP18Q9UMW8 372 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 OBSL1O75147 1896 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CD48P09326 243 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RARAP10276 462 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ATF6P18850 670 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJB2P25686 324 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DCAF6Q58WW2 860 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms