RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	CD302	Q8IX05	232 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	ASB7	Q9H672	318 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	IL21R	Q9HBE5	538 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	TENM4	Q6N022	2769 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	ZNF233	A6NK53	670 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP33	O14559	1287 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	EXOC3	O60645	756 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	GJB3	O75712	270 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	IL18RAP	O95256	599 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	NFIC	P08651	508 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	NR2F2	P24468	414 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	LRRC63	Q05C16	580 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	KDSR	Q06136	332 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	USP4	Q13107	963 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	JADE1	Q6IE81	842 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	TTI2	Q6NXR4	508 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	C11orf74	Q86VG3	221 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	NELFB	Q8WX92	580 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	SLC39A7	Q92504	469 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	FAM84A	Q96KN4	292 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	MAST4	O15021	2626 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	SERPINF2	P08697	491 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	ODC1	P11926	461 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	WNT7B	P56706	349 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	PAK1	Q13153	545 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	NAXD	Q8IW45	347 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RDH13	Q8NBN7	331 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	WHAMM	Q8TF30	809 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	TSG101	Q99816	390 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	HCN2	Q9UL51	889 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CS-231	ENST00000552222	PTPRB	P23467	1997 aa		14.71	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	BICDL2	A1A5D9	508 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYB561D2	O14569	222 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP17A1	P05093	508 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CKM	P06732	381 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP2F1	P24903	491 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CASP4	P49662	377 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CLDN6	P56747	220 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF33A	Q06730	810 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP24A1	Q07973	514 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ADAM9	Q13443	819 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ATP2A3	Q93084	1043 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SPACA7	Q96KW9	195 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MED15	Q96RN5	788 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	GCNT4	Q9P109	453 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DERA	Q9Y315	318 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	C2CD2	Q9Y426	696 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ACACA	Q13085	2346 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TRIM24	O15164	1050 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CETN3	O15182	167 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MAPK13	O15264	365 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CBFA2T3	O75081	653 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	GABRG2	P18507	467 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	STX17	P56962	302 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06

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