RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ARMT1Q9H993 441 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CFAP54Q96N23 3096 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PRKAB2O43741 272 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CEP104O60308 925 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SOD2P04179 222 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MYL1P05976 194 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PTGS1P23219 599 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 GNALP38405 381 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PSMD7P51665 324 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 EPHA5P54756 1037 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IQCB1Q15051 598 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CD276Q5ZPR3 534 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IRGCQ6NXR0 463 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SPATA21Q7Z572 469 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 AACSQ86V21 672 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SNX32Q86XE0 403 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CPXCR1Q8N123 301 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SLC39A13Q96H72 371 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 KCND1Q9NSA2 647 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 FBXO40Q9UH90 709 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MYO1CO00159 1063 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SLC26A4O43511 780 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MBD4O95243 580 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NDUFB10O96000 172 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CKMP06732 381 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 HSPA4P34932 840 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MAGEA9P43362 315 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PSMC6P62333 389 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CNTN2Q02246 1040 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 RCN1Q15293 331 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TOMM20Q15388 145 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BOLA3Q53S33 107 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BEND5Q7L4P6 421 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IL20Q9NYY1 176 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 C2orf81A6NN90 581 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SMTNL1A8MU46 457 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 F5H6K3 240 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZEB2O60315 1214 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NEMFO60524 1076 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BAIAP3O94812 1187 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MYL3P08590 195 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CYP2C9P11712 490 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ACTN1P12814 892 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 OAZ1P54368 228 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 UBASH3AP57075 661 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NHLH1Q02575 133 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 KLRC3Q07444 240 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ADCY1Q08828 1119 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 RASA2Q15283 850 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SLFN13Q68D06 897 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 KCTD1Q719H9 257 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 EPSTI1Q96J88 318 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 IPPKQ9H8X2 491 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NYAP2Q9P242 653 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 DSEQ9UL01 958 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 Q9Y3F1 56 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms