RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 AMFRQ9UKV5 643 aa16.26■□□□□ 0.19
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TRPS1-206ENST00000517323 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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TRPS1-206ENST00000517323 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.25■□□□□ 0.19
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TRPS1-206ENST00000517323 TDHQ8IZJ6 230 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-206ENST00000517323 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
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