RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	MGEA5	O60502	916 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CYP7B1	O75881	506 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	AKAP3	O75969	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	REC8	O95072	547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FGFR1	P11362	822 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SCG2	P13521	617 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	HLA-E	P13747	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	LAG3	P18627	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	NTHL1	P78549	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	GABPA	Q06546	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FAM3C	Q92520	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PIGK	Q92643	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SGSM2	O43147	1006 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PPM1B	O75688	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CLDN1	O95832	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	AKR1B1	P15121	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF28	P17035	718 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	BCKDHB	P21953	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	AMPD2	Q01433	879 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ICA1	Q05084	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ELF2	Q15723	593 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281		B4E1Z4	1266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281		H0YHG0	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CAND2	O75155	1236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	COQ9	O75208	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GJB3	O75712	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CCNE1	P24864	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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