RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NFU1	Q9UMS0	254 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ALPK3	Q96L96	1907 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DAPK3	O43293	454 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	UPP2	O95045	317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH2	P05091	517 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CD48	P09326	243 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNJ1	P48048	391 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CDH6	P55285	790 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT17	Q04695	432 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ADCY2	Q08462	1091 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NNT	Q13423	1086 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT81	Q14533	505 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CASP8	Q14790	479 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP1R7	Q15435	360 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TRADD	Q15628	312 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CCNG2	Q16589	344 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TAZ	Q16635	292 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FUT10	Q6P4F1	479 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	STRADA	Q7RTN6	431 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	RFX6	Q8HWS3	928 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC14L1	Q92503	715 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CAVIN3	Q969G5	261 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ERP44	Q9BS26	406 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP2K7	O14733	419 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	MDM4	O15151	490 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GAS8	O95995	478 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GALT	P07902	379 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	USP17L7	P0C7H9	530 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FGFR3	P22607	806 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ECHS1	P30084	290 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NOS2	P35228	1153 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	PBX3	P40426	434 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ARSE	P51690	589 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DYNLT1	P63172	113 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DCAF6	Q58WW2	860 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DUPD1	Q68J44	220 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	BBS12	Q6ZW61	710 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CEP57	Q86XR8	500 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HAUS1	Q96CS2	278 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	VWCE	Q96DN2	955 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	BRCA2	P51587	3418 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435		E7ENQ6	273 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	CAPN9	O14815	690 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	LIAS	O43766	372 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	CST8	O60676	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ENDOD1	O94919	500 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBED1	O96006	694 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TIMP1	P01033	207 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	LTF	P02788	710 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	GRIK1	P39086	918 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36

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