RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	EMC1	Q8N766	993 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CPT1B	Q92523	772 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MAML1	Q92585	1016 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	OSMR	Q99650	979 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TSC2	P49815	1807 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758		H3BRJ5	948 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	AP3B1	O00203	1094 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX3	O60493	162 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF4	P15884	667 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TPSB2	P20231	275 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NCAM2	O15394	837 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MTSS1	O43312	755 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DAB1	O75553	588 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GCAT	O75600	419 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DCTN3	O75935	186 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM155B	O75949	473 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT37	O76014	449 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	F9	P00740	461 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PFKM	P08237	780 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	INHBA	P08476	426 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MYL3	P08590	195 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MLN	P12872	115 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXC8	P31273	242 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NOS2	P35228	1153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MATK	P42679	507 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LIG3	P49916	1009 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINB9	P50453	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE4C	Q08493	712 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NAB1	Q13506	487 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MTFR1	Q15390	333 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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