RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 DAOAP59103 153 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ADCY2Q08462 1091 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 BOLA3Q53S33 107 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DEFB106AQ8N104 65 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DAPK3O43293 454 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SASH3O75995 380 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 KCNJ1P48048 391 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DUPD1Q68J44 220 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 STRADAQ7RTN6 431 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DPH5Q9H2P9 285 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CASP8Q14790 479 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CAVIN3Q969G5 261 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 VWCEQ96DN2 955 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 MAP2K7O14733 419 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 MDM4O15151 490 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 UPP2O95045 317 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ZBED1O96006 694 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GALTP07902 379 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CD48P09326 243 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 OR4Q2P0C623 313 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 NOS2P35228 1153 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SULT1E1P49888 294 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CDH6P55285 790 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 NNTQ13423 1086 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DCAF6Q58WW2 860 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FUT10Q6P4F1 479 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CEP57Q86XR8 500 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CALN1Q9BXU9 219 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 TIMP1P01033 207 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 USP17L7P0C7H9 530 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FGFR3P22607 806 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ARSEP51690 589 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 KRT81Q14533 505 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 PDK2Q15119 407 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 PPP1R7Q15435 360 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ZNF280DQ6N043 979 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 BBS12Q6ZW61 710 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ATL2Q8NHH9 583 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CCDC114Q96M63 670 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 E7ENQ6 273 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 LIASO43766 372 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ENDOD1O94919 500 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GAS8O95995 478 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CAPN2P17655 700 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ECHS1P30084 290 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 RFX6Q8HWS3 928 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 SCML4Q8N228 414 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 IRGQQ8WZA9 623 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 NT5C3BQ969T7 300 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 COL4A6Q14031 1691 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 OR6C75A6NL08 312 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CST8O60676 142 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DGKIO75912 1065 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GBP1P32455 592 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 KRT17Q04695 432 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DPYSL3Q14195 570 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 NPY6RQ99463 290 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms