RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFHC1Q5JVL4 640 aa29.07■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPNE8Q86YQ8 564 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIFAQ96CG3 184 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA17Q96L03 361 aa29.07■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM149B1Q96BN6 582 aa29.06■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 AMFRQ9UKV5 643 aa29.05■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 SCML4Q8N228 414 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAFFQ9ULX9 164 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 GREB1Q4ZG55 1949 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTAGE15A4D2H0 777 aa29.03■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 COMTP21964 271 aa29.03■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO16Q9Y6X6 1858 aa29.03■■■□□ 2.24
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TRAPPC10-202ENST00000380221 PGFP49763 221 aa29.01■■■□□ 2.23
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TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC14Q49A88 953 aa29.01■■■□□ 2.23
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TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
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TRAPPC10-202ENST00000380221 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
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TRAPPC10-202ENST00000380221 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
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TRAPPC10-202ENST00000380221 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
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