RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CLCN1P35523 988 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GPD2P43304 727 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK7P49862 253 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 UBASH3AP57075 661 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCCQ00597 558 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GRM2Q14416 872 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SCML4Q8N228 414 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA1Q92805 767 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SHDQ96IW2 340 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 LHX5Q9H2C1 402 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CYLDQ9NQC7 956 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQH9 124 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TULP2O00295 520 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 COCHO43405 550 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CALCAP01258 141 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TCF3P15923 654 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX5P35711 763 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS7P49802 495 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF445P59923 1031 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ADIGQ0VDE8 80 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 NR1I3Q14994 352 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PMF1Q6P1K2 205 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF276Q8N554 614 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 IRGQQ8WZA9 623 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A12Q96S37 553 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF38Q9H0F5 515 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ST7Q9NRC1 585 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX33O43247 280 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RARGP13631 454 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 LCP1P13796 627 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP11B1P15538 503 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PDGFRLQ15198 375 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF677Q86XU0 584 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ASIC4Q96FT7 647 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM62Q9BVG3 475 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ACP6Q9NPH0 428 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL26Q9Y258 94 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CPQQ9Y646 472 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PATJQ8NI35 1801 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 LEFTY2O00292 366 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHB6O15197 1021 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CBFA2T2O43439 604 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 OBSL1O75147 1896 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIOO75962 3097 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GFPT2O94808 682 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GLULP15104 373 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 JAM2P57087 298 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKCQQ04759 706 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 MTF1Q14872 753 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SCD5Q86SK9 330 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SIX5Q8N196 739 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC16Q8NEE8 873 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF139Q8WU17 664 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 IQCDQ96DY2 449 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP58Q9BVL2 599 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 MIS12Q9H081 205 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms