RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 WLSQ5T9L3 541 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CNDP1Q96KN2 507 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DCCP43146 1447 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KCNA4P22459 653 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GRK2P25098 689 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SOX11P35716 441 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TKTL1P51854 596 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ITIH4Q14624 930 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 RRN3Q9NYV6 651 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 RNF112Q9ULX5 631 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 EFEMP1Q12805 493 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MPP3Q13368 585 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 UCMAQ8WVF2 138 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT8Q92599 483 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 INPP5DQ92835 1189 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A8A0AV02 714 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 RBP1P09455 135 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 P3H2Q8IVL5 708 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ACKR2O00590 384 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SOX10P56693 466 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 REPS2Q8NFH8 660 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 APBB2Q92870 758 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CAVIN3Q969G5 261 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SETD4Q9NVD3 440 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 HPCAP84074 193 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NFIL3Q16649 462 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CRTAMO95727 393 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ITGALP20701 1170 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CORO7P57737 925 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 HORMAD1Q86X24 394 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 OPTNQ96CV9 577 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF333Q96JL9 665 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 APOL2Q9BQE5 337 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SYT15Q9BQS2 421 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MGAT5Q09328 741 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD8Q96I13 439 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 URODP06132 367 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GLI1P08151 1106 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NEK2P51955 445 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 WNT10BO00744 389 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TEX9Q8N6V9 391 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CLPBQ9H078 707 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SCN3BQ9NY72 215 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2F1P24903 491 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GRIK4Q16099 956 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 VHLP40337 213 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 LY6KQ17RY6 165 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 APPL1Q9UKG1 709 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRB1O14514 1584 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NDST1P52848 882 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SNTG2Q9NY99 539 aa20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms