RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERTAD4Q9NUC0 356 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR3EQ9NVU0 708 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPASTQ9UBP0 616 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAXQ9Y2V3 346 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NR2E3Q9Y5X4 410 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR81Q562E7 1941 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EML5Q05BV3 1969 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM265A0A087WTH1 108 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0D9SG52 128 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0J9YW62 118 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GWJ7 208 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYADML2A6NDP7 307 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCAF2A6NFQ2 919 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHF20L1A8MW92 1017 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIN1P1O15428 100 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPINT2O43291 252 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MSI1O43347 362 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DOK2O60496 412 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SORBS3O60504 671 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FCN3O75636 299 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDHD2O94830 711 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATG7O95352 703 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LY6G6CO95867 125 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ICAM1P05362 532 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT2P09544 360 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO45P0C2W1 286 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGA4P0DJD7 388 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGA3P0DJD8 388 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGA5P0DJD9 388 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHCEP18577 417 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDKN1BP46527 198 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UCP3P55916 312 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTBP2P56545 445 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00315P59091 139 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD164Q04900 197 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OLIG2Q13516 323 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM214AQ32MH5 1076 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FILIP1LQ4L180 1135 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AMOTQ4VCS5 1084 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FIGNL1Q6PIW4 674 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZRM9 215 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZS49 121 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF584Q8IVC4 421 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WWC1Q8IX03 1113 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADGRF2Q8IZF7 708 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FIBCD1Q8N539 461 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DTX3Q8N9I9 347 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP11CQ8NB49 1132 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL31RAQ8NI17 732 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC15Q8TF66 581 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KAT2BQ92831 832 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHBDF1Q96CC6 855 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRMOQ9BU70 441 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMUB1Q9BVT8 246 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP6D1Q9H9H5 199 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DZANK1Q9NVP4 752 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCPG1Q9ULG6 757 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SORCS3Q9UPU3 1222 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SATB2Q9UPW6 733 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUMBLQ9Y6R0 609 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLCH2O75038 1416 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRDM2Q13029 1718 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEDD4P46934 1319 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED14O60244 1454 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP10BO94823 1461 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RLFQ13129 1914 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0U1RQJ8 604 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TARM1B6A8C7 271 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 N4BP3O15049 544 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDPK1O15530 556 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DAB1O75553 588 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DGKIO75912 1065 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SBK3P0C264 359 aa-3.23□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms