RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA1Q92805 767 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA17Q96L03 361 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 IRAK3Q9Y616 596 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 ATF6P18850 670 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CAMK1Q14012 370 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 IRGQQ8WZA9 623 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CNPY3Q9BT09 278 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 DAB1O75553 588 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 LTFP02788 710 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 GLI1P08151 1106 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA31D3P0C874 917 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 DESP17661 470 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 ARCQ7LC44 396 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 DEFB106AQ8N104 65 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SCML4Q8N228 414 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 HES6Q96HZ4 224 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SNX12Q9UMY4 172 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 YIPF1Q9Y548 306 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 PLXNA3P51805 1871 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CAPN9O14815 690 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 TGM5O43548 720 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 ALDH1A3P47895 512 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 USP46P62068 366 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 ATP11AP98196 1134 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CDO1Q16878 200 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC14Q49A88 953 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 DPYSL4O14531 572 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 FSCN2O14926 492 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 RNF8O76064 485 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 MATKP42679 507 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 MTMR3Q13615 1198 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 DCAF6Q58WW2 860 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 MAFFQ9ULX9 164 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXA4-201ENST00000360046 RFXAPO00287 272 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 KCNK3O14649 394 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SRGAP2O75044 1071 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 YWHAQP27348 245 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CXCR5P32302 372 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 AMPD2Q01433 879 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 EDEM1Q92611 657 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 KRT35Q92764 455 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CD101Q93033 1021 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SCML2Q9UQR0 700 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MYO7AQ13402 2215 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 EPOPA6NHQ4 379 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 GLUD1P00367 558 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 NCAM1P13591 858 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 GJC1P36383 396 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MARCKSL1P49006 195 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ACAP1Q15027 740 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO32Q969P5 355 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC66A2RUB6 948 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 LRCH4O75427 683 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 NOS2P35228 1153 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN9P43378 593 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SULT1E1P49888 294 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TAS2R40P59535 323 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TWF1Q12792 350 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 VEPH1Q14D04 833 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms