RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PCYT2Q99447 389 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GPR20Q99678 358 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NEK6Q9HC98 313 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PALMDQ9NP74 551 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SETD4Q9NVD3 440 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TMEM150BA6NC51 233 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 O00370 1275 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZW10O43264 779 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TREHO43280 583 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TDP2O95551 362 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CCNE2O96020 404 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LGALS2P05162 132 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CTSHP09668 335 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 IFNAR1P17181 557 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CDH3P22223 829 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GRIA2P42262 883 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RABGGTBP53611 331 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 COG7P83436 770 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MFSD10Q14728 455 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CCDC6Q16204 474 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 VWA3BQ502W6 1294 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 IFT20Q8IY31 132 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 USP38Q8NB14 1042 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 BBOF1Q8ND07 529 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PPTC7Q8NI37 304 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SOBPA7XYQ1 873 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SFI1A8K8P3 1242 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SYCE1LA8MT33 242 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CENPBD1B2RD01 187 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KIAA0355O15063 1070 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TIMP1P01033 207 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SLC1A1P43005 524 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PSEN2P49810 448 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP4P98171 946 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PPP2R2BQ00005 443 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MBTPS1Q14703 1052 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PSMD6Q15008 389 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 WDR59Q6PJI9 974 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CORO6Q6QEF8 472 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SPATA20Q8TB22 786 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TMEM237Q96Q45 408 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GDF3Q9NR23 364 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 IFT52Q9Y366 437 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NFS1Q9Y697 457 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LRRC72A6NJI9 287 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ALOX15BO15296 676 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CHMP2AO43633 222 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF15O94989 841 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 OLFM2O95897 454 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZNF12P17014 697 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 HOXC13P31276 330 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KRT6CP48668 564 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 AP2B1P63010 937 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CHRNEQ04844 493 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms