RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SLC15A2Q16348 729 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 MCEEQ96PE7 176 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DGKIO75912 1065 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 MCL1Q07820 350 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SIX5Q8N196 739 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 C9orf72Q96LT7 481 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf22Q49AR2 442 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SHC4Q6S5L8 630 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 KCTD1Q719H9 257 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SFRP1Q8N474 314 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SPATA17Q96L03 361 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PHF11Q9UIL8 331 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 E9PBE3 544 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 NCAM2O15394 837 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PHKA1P46020 1223 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PTENP60484 403 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZFP69Q49AA0 526 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 BHMTQ93088 406 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 IRGMA1A4Y4 181 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB39O15060 712 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 RALAP11233 206 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TMIEQ8NEW7 156 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ITFG2Q969R8 447 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 MUC13Q9H3R2 512 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DENND3A2RUS2 1198 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CPA2P48052 419 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 IL5RAQ01344 420 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 UBDO15205 165 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 BMP10O95393 424 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 KIZQ2M2Z5 673 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF284Q2VY69 593 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB33Q86T24 672 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CD302Q8IX05 232 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 KCNB2Q92953 911 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 LXNQ9BS40 222 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PRELID1Q9Y255 219 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 UNC13BO14795 1591 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 F8W810 466 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF605Q86T29 641 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PAFAH2Q99487 392 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 HAT1O14929 419 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 UNC5CO95185 931 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SLC2A3P11169 496 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ADSSP30520 456 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 GTF2H1P32780 548 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 GP5P40197 560 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC185Q8N715 623 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF221Q9UK13 617 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.48□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 GLI2P10070 1586 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TSPOAP1O95153 1857 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ATG7O95352 703 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ATP12AP54707 1039 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PSMC5P62195 406 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.47□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 FBXO40Q9UH90 709 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms