RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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CSDE1-201ENST00000261443 ZMPSTE24O75844 475 aa7.49□□□□□ -1.21
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CSDE1-201ENST00000261443 STAMBPO95630 424 aa7.49□□□□□ -1.21
CSDE1-201ENST00000261443 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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