RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR44Q5JSH3 913 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TTI2Q6NXR4 508 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 WHAMMQ8TF30 809 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO32Q969P5 355 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC35C1Q96A29 364 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CYFIP2Q96F07 1278 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SMOQ99835 787 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 BICDL2A1A5D9 508 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM92AA1XBS5 289 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 GFRA3O60609 400 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 BEST1O76090 585 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC5A3P53794 718 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC7A9P82251 487 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 MTAPQ13126 283 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC32Q14392 662 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 NELFBQ8WX92 580 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF38Q9H0F5 515 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM200BP0CF97 657 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ARSAP15289 507 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ADORA2BP29275 332 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 IFNAR2P48551 515 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K7CLP57077 242 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 AMPD2Q01433 879 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PON2Q15165 354 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPRNQ16849 979 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC16Q8NEE8 873 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CISHQ9NSE2 258 aa18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PRR23AA6NEV1 266 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ZXDBP98169 803 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CLEC20AQ6ZU45 233 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CPA6Q8N4T0 437 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP2A3Q93084 1043 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ARID3AQ99856 593 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ECT2Q9H8V3 914 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 R4GN57 208 aa18.19■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 LEFTY2O00292 366 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PMM2O15305 246 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 FMO5P49326 533 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 TUBP50607 506 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 RAD23BP54727 409 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PAK1Q13153 545 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CCINQ13939 588 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 EML3Q32P44 896 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF394Q53GI3 561 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 HECTD3Q5T447 861 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CHFRQ96EP1 664 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PNPLA8Q9NP80 782 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CPQQ9Y646 472 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.18■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 HHLA1C9JL84 531 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 COCHO43405 550 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CCNYL3P0C7X3 344 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 GJA4P35212 333 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CCR3P51677 355 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 NR1H3Q13133 447 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CUL2Q13617 745 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 GAS6Q14393 721 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP2R5DQ14738 602 aa18.17■□□□□ 0.5
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMK4Q16566 473 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms